El club está situado en el barrio de Shimizu, en Shizuoka y disputa sus partidos como local en el IAI Stadium Nihondaira.
Durante sus primeras temporadas S-Pulse luchó por conseguir la Liga, comandado por entrenadores internacionales como Osvaldo Ardiles o Steve Perryman.
Tras ganar la Recopa en el año 2000, Shimizu S-Pulse vence en 2001 en la Copa del Emperador, no sin antes haber terminado la primera y segunda ronda de liga en cuarta posición.
Desde 2002 el equipo no ha ganado ningún título, siendo el año 2008 su ocasión más cercana cuando perdieron la final de la Copa J. League ante Oita Trinita.
El partido no se abrió hasta el minuto 63 cuándo una mano en el área de Tokyo Verdy cometida por el centrocampista y capitán Koki Morita fue señalada como penalti, este fue ejecutado exitosamete por el delantero Brasileño Thiago Santana, poniendo a Shimizu en ventaja 0-1.
[3] El campo donde Shimizu S-Pulse disputa sus partidos como local es el Outsourcing Stadium Nihondaira, que cuenta con capacidad para 20.399 personas y césped natural.
S-Pulse entrena en Miho Ground, un campo donde además las categorías inferiores disputan sus partidos y donde el equipo dispone de sus oficinas centrales desde su creación.
Este partido normalmente se lleva a cabo en el Estadio Ecopa, el recinto más grande de la prefectura.