La corriente de Humboldt se caracteriza además, por sus aguas ricas en nutrientes debido a la surgencia (upwelling).

El frente ecuatorial es afectado también por la ocurrencia periódica (cada 4 a 5 años) de los eventos relacionados al "El Niño"-oscilación Sur (ENSO, por sus siglas en inglés), los cuales modifican la temperatura y la salinidad oceánicas.

En efecto estos organismos no pueden desplazarse cuando las condiciones de salinidad y temperatura se tornan extremas.

La biodiversidad marina del Pacífico Oriental Tropical, ha sido escasamente estudiada, existiendo pocos registros taxonómicos publicados en la literatura científica.

[5]​ reporta una alta diversidad de poríferos y cnidarios asociados a ambientes rocosos.

Entre los sitios con mayor diversidad de especies en esta área, se encuentran a La Cabeza del Viejo, Zona Protegida, La Pared y El Bajo Cuarenta, reportando una gran diversidad con diecisiete especies de octocorales pertenecientes a las familias Plexauridae (8), Gorgoniidae (8) y Clavularidae (1).

[6]​[7]​ En la REMAPE las primeras descripciones taxonómicas del grupo Porífera reportan la presencia de Callyspongia aff.

Entre las especies de zoantharios identificados, presentan riqueza química, Terrazoanthus patagonichus del cual se ha identificado una nueva familia de alcaloides 2-aminoimidazole llamados Terrazoanthines A-C[15]​ Adicional a estos, nuevos derivados de ecdysteroides llamados ecdysonelactones A-D han sido identificados en Antipathozoanthus hickmani [16]​ especie únicamente reportada para la ecorregión del TEP.

El estudio químico Zoanthus pulchellus, mostró alcaloides zoanthamines[17]​ En tanto de la esponja C. cf californica se aislaron ácidos callyspongidicos.