Un sistema volcánico, conocido como Santa Clara forma gran parte del paisaje, incluidos tres picos, el Pinacate, Carnegie, y Medio.

Los más altos de los picos son Cerro del Pinacate (también llamado Volcán Santa Clara), la elevación 3904 pies (1190 m).

[7]​ Una segunda etapa de ocupación por el pueblo San Dieguito comenzó al final del seco periodo glacial.

Las tinajas deben haber sido una fuente segura de agua durante este tiempo que terminó con la llegada de otro periodo antitérmico seco y caliente, hace aproximadamente 9000 años y que otra vez forzó a los indígenas a abandonar la tierra.

[2]​ Los colonizadores del Pinacate y Gran Desierto de Altar son conocidos como los areneños.

Al igual que el antiguo pueblo San Dieguito, los pinacateños recorrieron la sierra llegando hasta el mar buscando comida y concentrando sus campamentos cerca de las tinajas.

Sin embargo, los pimas vivieron principalmente a lo largo del río Gila en Arizona, mientras que los pápagos y los areneños sí ocuparon la región de El Pinacate.