La separación jurídica entre ambos será ratificada el 23 de marzo del mismo año por el papa Paulo IV, que concede a la universidad soberanía académica y económica.En 1695 se aprueban unas nuevas Constituciones de la Universidad, las terceras y definitivas.Pese a ello, la Universidad sigue compartiendo instalaciones con el Colegio de Sta.La Real Universidad de Toledo se instala en la que será su tercera sede, el convento de San Pedro Mártir, compartiendo el edificio con la universidad dominica (la cual, por su parte, subsistirá hasta 1835).Mientras tanto el ilustrado Cardenal Lorenzana adquirió en 1792 las casas de la Inquisición y otras ocho contiguas y mandó derribarlas, para edificar en su solar una nueva y digna sede para la Real Universidad de Toledo, el edificio que más adelante llevaría su nombre.Por su parte, cuando se produjo la separación entre universidad y colegio, el segundo continuó su trayectoria en su antiguo edificio hasta su cierre, que se produjo también en 1845, a causa de la supresión de la Universidad.Resulta sólido y tiene una escrupulosa cantería; es muy limpia la solución de los dinteles que corren sobre las columnas, mostrando falsas juntas verticales.Este da paso a un magnífico patio neoclásico, de un porte monumental, tanto por sus estimables dimensiones y proporciones, como por su orden único, jónico, que soporta un fuerte entablamento adovelado, todo ello de granito.
Escultura de la fachada principal.
Escalinata en la fachada del Palacio del Cardenal Lorenzana.
