Discurre íntegramente por la provincia de Burgos durante unos 50 km.
Su nombre proviene de la principal localidad que recorre, Ubierna.
[1] Como ocurre en la mayoría de los ríos que nacen en zonas calizas, y por tanto de alta porosidad, el Ubierna no tiene un solo alumbramiento, sino que se surte de numerosas surgencias próximas entre sí.
En ellas destacan dos: Existen otras fuentes pero de menor importancia, que sólo adquieren cierto relieve en épocas de fuertes precipitaciones o rápidos deshielos, como la famosa Fuente Maján, situada a dos kilómetros al oeste de Quintanilla y donde la tradición sitúa un pueblo desaparecido que se llamó Maján, o la Cueva Rulladera, en el término de Valdemiguel.
[2] Por su margen derecha: Por su margen izquierda: Se trata de un río que lleva poco caudal en verano, pero que ve aumentando notablemente su caudal en invierno, que llega a desbordarse cada pocos años.