Las localidades que atraviesa el río son Zegama, Segura, Idiazábal, Olaberría, Beasáin, Ordicia, Isasondo, Legorreta, Ikaztegieta, Alegia, Tolosa, Anoeta, Irura, Villabona, Zizurkil, Aduna, Andoáin, Lasarte-Oria, Usúrbil y Orio, localidad junto a la que desemboca.

Aparece descrito en el duodécimo volumen del Diccionario geográfico-estadístico-histórico de España y sus posesiones de Ultramar de Pascual Madoz con las siguientes palabras:[2]​ Es un río que sufrió una gran contaminación debido a la fuerte industria asentada en sus orillas, especialmente industria papelera, entre los años 50 y 80 del siglo XX especialmente.

A partir de los años 1990 un mayor interés por cuidar el medio ambiente hizo que las industrias dejaran de verter las aguas residuales directamente al río, construyendo depuradoras en distintos puntos de su cauce para este fin.

Hoy en día es un río a cuyas aguas ha vuelto una gran parte de la vida piscícola, sobre todo de truchas.

En el año 2013 la cuenca baja fue incluida dentro de la red Natura 2000 tras la recuperación de los humedales desecados a comienzos del siglo XX para su uso agrícola.