A su vez, Juba era el hijo del rey Juba I, el rey bereber de Numidia que luchó del lado de Pompeyo contra César en la Guerra Civil.

En el año 19, su padre, ya anciano, lo asoció al trono y en 23, cuando este murió, Ptolomeo se convirtió en soberano.

Aunque los rebeldes fueron finalmente derrotados, ambas partes sufrieron un alto número de pérdidas, tanto en caballería como en infantería.

Estas muestras de reconocimiento eran una antigua tradición romana que fue revivida por el Senado.

Tuvieron un único hijo, Cayo Julio Aexio, que sucedió a su padre como rey y sumo-sacerdote del dios El-Gabal.