Un péptidomimético es una estructura similar a la proteína, diseñada para imitar un péptido, capaz de reemplazarlo en sus interacciones con receptores y enzimas.[4] En general, los peptidomiméticos están hechos para imitar ciertos péptidos activos mientras tienen una vida media más larga en el cuerpo o una mayor afinidad.Los siguientes dos ejemplos imitan las proteínas involucradas en las interacciones proteína-proteína clave que reactivan la vía apoptótica en el cáncer pero lo hacen por mecanismos distintos.En 2004, Walensky y sus colaboradores informaron sobre un péptido alfa helicoidal estabilizado que imita las proteínas pro-apoptóticas.[5] Esta molécula fue diseñada para estabilizar la estructura helicoidal nativa formando un macrociclo entre cadenas laterales que no están involucradas en la unión.
Figura 2. Los D-péptidos asumen la conformación de la imagen especular de sus análogos
L
-péptidos.
Muchas
D
-proteínas y otros
D
-péptidos cuando se colocan en un disolvente no quiral como el agua, asumen la conformación de la imagen especular de su contraparte
L
-péptido. La imagen es un fragmento de un
L
-péptido (1) con la secuencia Asp-Val-Ser y el
D
-péptido Asp-Val-Ser (2) que se muestra desde el extremo C al extremo N-terminal.
L
-tripéptido (izquierda) en comparación con
D
-tripéptido (derecha)
Tri-β-péptido genérico con cadenas laterales "R"
Comparación entre un tripéptido Phe-Leu-Glu (izquierda) y un tripéptido con las mismas cadenas laterales (derecha).