El osario contiene aproximadamente 40.000 esqueletos humanos, colocados artísticamente para formar la decoración y el mobiliario de la capilla.Durante la Peste Negra a mediados del siglo XIV, y después de las guerras husitas a principios del siglo XV, miles de personas fueron enterradas allí y el cementerio tuvo que ser ampliado considerablemente.Alrededor del año 1400 se construyó una iglesia gótica en el centro del cementerio, con una bóveda en un nivel superior y una capilla en el sótano como un osario para las tumbas de masas desenterradas durante la construcción o simplemente para hacer sitio para nuevos entierros.Entre 1703 y 1710 se edificó una nueva entrada para apoyar la pared delantera, que se inclinaba hacia el exterior, y la capilla superior fue remodelada.Este trabajo, en el estilo checo barroco, fue diseñado por Jan Santini Aichel.
