Dos años más tarde en 1654 convocó un concilio en el que obligó a sus sacerdotes a aceptar una revisión completa de los textos sagrados, que él tradujo y adaptó de los textos griegos; construyó y reformó monasterios y los dotó de valiosas colecciones, sus emisarios recorrieron el Oriente Medio y Rusia buscando manuscritos, tanto profanos como sagrados, que pudieran acercar la iglesia rusa a sus orígenes griegos, creyó que Rusia se convertiría en el centro espiritual y político de la Iglesia ortodoxa.
La reforma suscitó la violenta reacción del protopapa Avvakum, jefe de los viejos creyentes.
El septuagenario monje no pudo sobrevivir al largo viaje falleciendo en la Iglesia Nikolo-Trópinskaia en las proximidades de Yaroslavl.
En 1682, el zar consiguió la devolución post mortem del título de patriarca a Nikon.
La única información al respecto procede de la Vida escrita por el antiguo hipodácono del patriarca, Ivan Shusherin.
Su apellido, sin embargo, aparece en la literatura en versiones de Minow, Minin[3][4] o Minin-Larionov[3].
Los tres hermanos del futuro patriarca se llamaban Grigory, Semyon y Nikifor.
Según Life, su madrastra odiaba a Nikita hasta tal punto que intentó matarlo tres veces.
Nikita estudiaba las Sagradas Escrituras por su cuenta, además, cantaba con especial afición durante los oficios.
(en otra versión un mordvino) predijo al futuro jerarca que se convertiría en Patriarca de Moscú.
El joven obediente no hizo los votos monásticos porque su familia le exigió que se casara.
Su matrimonio resultó infructuoso; además, todos sus hijos (tres de ellos) murieron prematuramente.
Este autor no tiene ninguna duda de que la vocación del monje Nikon era auténtica[6].
Según recordó varios años después, fue arrojado a tierra en la isla de Kij.
Cuando el tiempo se calmó, el clérigo llegó a tierra firme, y luego se trasladó al sur durante diez días antes de llegar finalmente al monasterio Kożejezierski de la Epifanía[6].
A los ojos de los monjes, él era la continuación de la obra del monje Nicodemo, que había pasado 30 años en completa reclusión en el mismo lugar y era considerado un anciano santo.
Su autoridad creció tanto que en 1642, tras la muerte del anterior superior, el ihumen Jonás, Nikon fue elegido como su sucesor y elevado a la dignidad de ihumen por el metropolitano de Nóvgorod[7].
Nikon viajó repetidamente a Moscú para recaudar fondos para el monasterio, haciendo amistades que tuvieron un impacto significativo en su posterior carrera clerical.
La Eparquía también recibió cuantiosas concesiones de tierras del zar Alexei I[11].
Sin embargo, la popularidad del jerarca decayó debido al duro trato que recibía el clero bajo su mandato, así como la población laica de Nóvgorod[7], aunque Nikon también llevó a cabo amplias actividades caritativas, apoyando económica y materialmente a los más pobres{[11].
Al año siguiente, el metropolitano obtuvo del zar prerrogativas únicas en comparación con las que disfrutaban otros jerarcas en cuanto a poder judicial sobre el clero eparquial y los campesinos pertenecientes a monasterios: Nikon recibió el derecho exclusivo de juzgarlos, excepto en casos de robo y asesinato.
Según S. Solovev, el zar decidió personalmente la elección de Nikon, a quien consideraba su partidario y amigo[7].
Sin embargo, este último se negó a aceptar la dignidad y señaló al propio Nikon como el candidato más adecuado.