Neokaryotes es un clado eucariota propuesto por Cavalier-Smith en 1993 que consiste en los opimodos y los corticados como grupos hermanos.

Este clado surgió porque los excavados otro grupo de protistaa se ven como los más basales dentro los eucariotas.

Otras propuestas en conflicto unen a los excavados con los corticados en un clado llamado Bikonta o Diphoda y con Opimoda en el reino Protozoa.

Es posible que los excavados sean un grupo parafilético relacionado con el origen de los demás eucariotas.

Una posible filogenia encontrada por Cavalier-Smith y colaboradores es la siguiente:[4]​[5]​[6]​[7]​[8]​[9]​ Euglenozoa Percolozoa Tsukubea Jakobea Supergrupo SAR Hacrobia Plantae (=Archaeplastida) Metamonada Malawimonadea Varisulca Amoebozoa Apusozoa Fungi Animalia