Apusozoa es un grupo de protistas flagelados que presentan típicamente filopodios (seudópodos filosos) ventrales y mitocondrias con crestas tubulares.

La segunda (Breviatea) comprende uniflagelados ameboides carentes de la capa pelicular y con deslizamiento apoyado en el flagelo anterior.

Apusozoa fue propuesto originariamente por Cavalier-Smith, que recientemente lo ha incluido, junto a otros grupos similares, en Sulcozoa, también parafilético.

Estos organismos, a pesar de presentar generalmente dos o más flagelos, se incluyen como grupo basal en el clado Amorphea (= Unikonta).

El grupo se amplió en 2011 con el cuarto orden, Mantamonadida, para incluir a unos recién descubiertos flagelados marinos que viven en los sedimentos costeros.