[2]​[3]​ El nombre Hacrobia deriva de Haptophyta, Cryptophyta (los dos subgrupos principales) y bia (que es un subfijo general para referirse a la vida).

Cavalier-Smith considera que Hacrobia está relacionado con el supergrupo SAR e incluye a ambos en el reino Chromista.

Comprende los siguientes grupos: La filogenia interna podría ser la siguiente:[1]​[8]​ Microhelida Heliomonadida Picozoa Telonemia Palpitia Kathablepharida Goniomonadea Cryptophyceae Alveidia (=Provora) Centrohelida Rappemonada Pavlovophyceae Prymnesiophyceae A continuación se muestran las tres posibilidades que se han considerado para Hacrobia: Euglenozoa Excavata Plantae Hacrobia

La alternativa es que los cloroplastos fueran adquiridos independientemente por los distintos linajes, por transmisión horizontal, en vez de por herencia.

2016,[7]​ realizan una secuenciación de transcriptomas del grupo Centrohelida que les permite reconstruir los datos filogenéticos faltantes.

[14]​ Adicionalmente, un trabajo del año 2009 sugiere que estos grupos junto a Telonemia y Centrohelida pueden formar un clado.

[15]​ De la misma forma, Picozoa podría pertenecer a este grupo, aunque los datos no son concluyentes.

[16]​ Haptista sería un grupo hermano del supergrupo SAR, mientras que Cryptista estaría más próximo a Archaeplastida (las plantas en sentido amplio).