Es un museo de titularidad municipal, levantado sobre los terrenos del pago de Vistaverde, donde se encontraba la antigua fábrica de harinas «El Palero», un complejo industrial que fue respetado parcialmente para albergar la exposición permanente del museo.
En él los interesados disfrutarán de variados y espectaculares programas audiovisuales sobre la atmósfera terrestre, el Sistema Solar, las estrellas y galaxias, la evolución del Universo, etc. algunos de ellos en directo, guiados por especialistas en astronomía.
Entre la programación educativa ofrecida por el Museo de la Ciencia se incluye:
La Casa del Río, inaugurada en mayo de 2007 y ampliada en diciembre de 2009, es el espacio expositivo permanente del Museo de la Ciencia de Valladolid en el que se explican los ecosistemas fluviales, haciendo especial hincapié en el del río que pasa por Valladolid, el Pisuerga.
Una zona en la que se pueden observar las principales especies de peces, anfibios y crustáceos que habitan o habitaron las aguas y riberas del río Pisuerga.