Desde 1898, ocupa la primera planta del Palais Rohan,[1]​ diseñado por el arquitecto Robert de Cotte y construido entre 1728 y 1741, un edificio que también alberga el Musée des Arts décoratifs, en la planta baja, dedicado a las Artes decorativas, y el Museo Arqueológico de Estrasburgo, en el sótano.

[1]​ La colección permanente del museo está compuesta por las obras de artistas no procedentes de la región del Rin Superior desde el siglo XIV hasta 1870 y obras de los artistas del Rin Superior entre 1681 y 1870, siendo el año siguiente la fecha en la que se anexiona Alsacia y Lorena al Imperio alemán.

Artistas tempranos representadas incluyen Giotto y Memling[1]​ (Tríptico de la vanidad terrenal).

Del Renacimiento y Manierismo hay obras de Botticelli,[1]​ Rafael,[1]​ Veronés[1]​ –cuya Céfalo y Procris, adquirida en Venecia para Felipe IV por Velázquez en 1651, hacía pareja en la colección real española con el Venus y Adonis del Museo del Prado hasta que José Bonaparte se apropió de ella a comienzos del siglo XIX[2]​– Lucas van Leyden,[1]​ Hans Baldung Grien (Autorretrato) y el Greco (La virgen María[3]​[4]​).

Del Barroco, Clasicismo y el Naturalismo hay obras de Rubens,[1]​ Van Dyck,[1]​ Vouet,[1]​ Champaigne,[1]​ Largillière,[1]​ Canaletto,[1]​ Tiepolo,[1]​ Ribera (San Pedro y San Pablo[4]​), Zurbarán (Santa Úrsula y Santa Engracia) y Goya (Retrato de Bernardo Yriate[4]​).