[1] Su sede se encuentra en el Palacio Baburizza, en el paseo Yugoslavo del cerro Alegre de Valparaíso.Con las obras allí premiadas, pinturas propias y algunas adquisiciones que había hecho, inauguró la galería.Pero el terremoto de aquel año y el incendio que se desató después destruyeron el inmueble.Así, en 1972 comenzó la tercera etapa en la vida del museo, que duró un cuarto de siglo, hasta 1997,[3] cuando se cerró debido a su deterioro.[1] En esa tercera etapa, el público podía ver 80 obras, ya que se utilizaba únicamente la casa principal del millonario, pero no la de atrás,[1] donde vivía su sobrino Juan con Irma, la esposa de este, quien administraba la casona, ya que Pascual Baburizza era soltero.Además, en el antiguo garaje funciona una tienda y, sobre ella, una cafetería con su terraza, espacios que el museo concesiona.[7] Estas pinturas, que conforman la llamada Colección Baburizza está distribuida por los salones del primer piso; solo los pasteles en papel de Jeanne o Jane Pinot han sido subidos a la mansarda, a la pequeña sala que se encuentra en su extremo izquierdo.
