San Carlos Yautepec se encuentra ubicado en la región Sierra Sur y en el distrito de Yautepec.

[1]​ La densidad de población asciende a un total de 5.11 personas por kilómetro cuadrado.

El municipio tiene un total de 50 localidades, la población de las principales es las siguientes: El gobierno de San Carlos Yautepec se rige por principio de usos y costumbres que se encuentra vigente en un total de 424 municipios del estado de Oaxaca y en las cuales la elección de autoridades se realiza mediante las tradiciones locales y sin la intervención de los partidos políticos.

El ayuntamiento de San Carlos Yautepec está integrado por el presidente municipal, un síndico y un cabildo integrado por seis regidores.

Para la elección de diputados locales al Congreso de Oaxaca y de diputados federales a la Cámara de Diputados federal, el municipio de San Carlos Yautepec se encuentra integrado en los siguientes distritos electorales: Local: Federal: