El municipio de San Pedro Mixtepec (del náhuatl: mixtli, tepetl ‘nube, cerro’‘En el cerro de las nubes’), estadísticamente llamado San Pedro Mixtepec -Distrito 26- para diferenciarlo de la demarcación homónima, es uno de los 570 municipios que conforman al estado mexicano de Oaxaca.
Su cabecera es la localidad de San Pedro Mixtepec.
[3] Se teoriza que los primeros habitantes de la región fueron de origen zapoteco, procedentes del Valle de Oaxaca a inicios del siglo XVI.
[3] Tiene límites administrativos con los siguientes municipios y/o accidentes geográficos, según su ubicación:[4] Una porción del municipio pertenece a la región hidrológica de Tehuantepec, a través de la cuenca del río Tehuantepec y la subcuenca del río San Antonio.
El clima del municipio es clasificado como templado subhúmedo con lluvias en verano en el 75 % de su territorio, semifrío subhúmedo con lluvias en verano en el 13 %, semicálido subhúmedo con lluvias en verano en el 11 % y semiseco semicálido en el 1 % de su territorio.