Su familia, de padres cibaeños (región Norte dominicana), y cuatro hermanos, todos músicos, emigró a la ciudad de Nueva York, donde ella cursó estudios secundarios y universitarios, graduándose en 1980 con alto honor en Comunicaciones & Medios, del City College of New York.
En 1995 bajo el sello RTP Records, lanzó su producción titulada En tus manos, producida por Rafael Vásquez, su esposo y mánager durante 20 años.
En 1997 firma con Sony Discos, lanzando su primera producción como solista: Hasta siempre, dedicada en su totalidad a Rafael Vásquez.
En 2003 obtuvo el Premio Grammy Latino en la categoría «Álbum de Merengue del Año», convirtiéndose en la primera artista femenina dominicana en lograr este galardón.
En 2009 Milly presentó su concierto Milly Quezada Unplugged en el Hard Rock Cafe de Santo Domingo, donde participaron junto con ella varios artistas dominicanos, como Pavel Núñez, Marel Alemany, Vicente García, MasQueDos y su hijo Miguel Vásquez.
Milly posee el récord de ser la artista femenina con más presentaciones en el afamado Festival Presidente, en cuya última edición en 2017 fue la única artista femenina en presentarse, reafirmando así su corona de reina del merengue.