Hijo de James Thornton y Elizabeth Jenkins, quienes emigraron a América del Norte en 1716, cuando este tenía tres años; estableciéndose primero en Wiscasset.
Completó estudios en medicina en Leicester (Massachusetts) y estableció una práctica médica en Londonderry.
Se casó con Hannah Jack en 1760 y la pareja tuvo cinco hijos.
Se mudó a Merrimack (Nuevo Hampshire) en 1780, donde formó y operó el Ferry de Thornton con su familia.
Está enterrado en el Cementerio de Thornton en Merrimack (Nuevo Hampshire), y en su cenotafio se lee "El hombre honesto".