María era la quinta de los vástagos y la tercera hija del futuro emperador del Sacro Imperio Romano Germánico Fernando I y de Ana Jagellón.
María recibió una estricta y minuciosa educación religiosa católica del humanista Kaspar Ursinus Velius .
En el momento de su matrimonio, María fue descrita como una mujer no erudita sino “dispuesta a aprender” y bien educada; no hermosa sino “dotada de belleza”.
María procedía de una familia fértil, al igual que Guillermo.
Su hijo mayor vivió hasta convertirse en adulto, pero murió trágicamente a los 20 años, dejando a su único hijo sobreviviente, Juan Guillermo, como sucesor de su padre.
María probablemente también padecía una enfermedad mental, al igual que su abuela, la reina castellana Juana I de Castilla.
Su salud mental se deterioró y murió a la edad de 50 años.
María fue enterrada en laStiftskirche de Cléveris, pero no hay ninguna placa en su tumba.