[9]​ Al proclamarse la Primera República en 1873, mientras tenía lugar la tercera guerra carlista, solicitó su licencia absoluta en el Ejército gubernamental y, a principios de 1874, ingresó en el Ejército carlista del Norte con el empleo de Coronel.

A poco de entrar en campaña, cayó del caballo que montaba y resultó herido, lo que le impidió tomar parte en las operaciones militares durante algunos meses.

[13]​ El hermano de Antonio correría mejor suerte: Según Fernán Altuve-Febres, tras recuperarse, Manuel Fernández de Prada participaría incluso en la guerra del Pacífico contra el Ejército chileno.

Hasta el final de su vida mantuvo sus ideales tradicionalistas, y era suscriptor del citado diario.

Al estallar la guerra civil española, este último y tres de los siete hijos del mismo, Antonio Jesús, José María (ambos abogados) y el menor, Francisco de Asís, se encontraban en Madrid.

Todos ellos fueron apresados por milicianos y acusados de pertenecer al Requeté.