[2]​ Su padre, D.A. Rajapaksa fue miembro del parlamento de Sri Lanka.

En 1994, Rajapaksa fue nombrado Ministro de Trabajo y ejerció ese cargo hasta 1997.

[2]​ Luego que asumiera la presidencia, Rajapaksa modificó el gabinete, nombrando a Ratnasiri Wickremanayake primer ministro del país.

El primer ministro titular Ranil Wickremesinghe se negó a aceptar el despido y declaró que era inconstitucional, lo que resultó en una crisis constitucional.

Durante la guerra contra los Tigres de Liberación del Eelam Tamil, ha dirigido la ofensiva militar para aplastarlos, era líder de las fuerzas armadas esrilanquesas.