Los filos pertenecientes a Lophophorata son los briozoos (o ectoproctos), los braquiópodos, los foronídeos y los hiolitos, un grupo extinto.

Los lofoforados constituyeron antiguamente un filo, aunque hoy hay pocos zoólogos que mantengan esta opinión.

Todos los filos de lofoforados tienen un registro fósil que se extiende desde el Cámbrico hasta la actualidad.

El lugar que ocupan los lofoforados en el esquema clasificatorio del reino animal es controvertido, no habiendo acuerdo entre los distintos investigadores.

Los lofoforados antiguamente fueron considerados parte de los deuteróstomos debido a que poseen segmentación radial del huevo y otras similitudes morfológicas con estos animales.