[3]​ Un individuo se compone de un cáliz semiesférico delimitado por una corona de tentáculos que encierra la boca y el ano y un pedúnculo contráctil que lo fija al sustrato.

Después de la boca hay un esófago que conduce el alimento hacia un amplio estómago.

En cada tentáculo hay tres bandas de cilios: una central y dos laterales.

En la mayor parte de los casos, los embriones son incubados en la cavidad atrial, situada en el centro del cáliz.

Las larvas tienen fototropismo negativo, de modo que buscan lugares oscuros para fijarse y transformarse en adulto.

Según esta perspectiva, entoproctos y ectoproctos no están directamente emparentados y sus similitudes son debidas a la convergencia evolutiva ya que el grupo hermano de Entoprocta es Cycliophora.