Para sortear esto, el malato transporta los equivalentes reductores a través de la membrana.
El malato recolectó dos electrones del NADH, ya que el átomo de hidrógeno pasa como un ion hidruro (:H-).
[3] Una vez formado el malato, actúa el primer transportador antipuerto (malato-alfa-cetoglutarato), que importa malato del citosol a la matriz mitocondrial y al mismo tiempo exporta alfa-cetoglutarato de la matriz al citosol.
Una vez que el malato está en la matriz actúa sobre el la malato deshidrogenasa mitocondrial, que lo convierte en oxaloacetato, y durante la reacción un NAD+ mitocondrial recoge un átomo de hidrógeno (un hidruro de dos electrones) y se libera un protón, por lo que se reduce a NADH + H+.
[2] El oxaloacetato formado en la reacción anterior no tiene transportador para volver al citosol.