El Jun'yō fue uno de los pocos portaaviones japoneses que sobrevivieron intactos a la guerra.En comparación con otros portaaviones reconvertidos desde buques de línea, como la clase Taiyō por ejemplo, el Jun'yō resultó mucho mejor armado, velocidad superior, mejor diseñado al dotársele de un puente isla a estribor con una chimenea inclinada en 26° siendo esto una innovación efectiva para el desvío de humareda sobre cubierta y que fue más tarde replicada en el Taihō y Shinano.[3] El Hiyō fue hundido al día siguiente de esa acción.Sin embargo pronto el Jun'yō fue divisado por el submarino USS Hackleback, que le disparó una salva de 3 torpedos, los cuales impactaron en estribor y causaron explosiones e incendios graves, haciendo escorar al barco y obligándolo a encallar para evitar que se hundiera.Llegó a Sasebo 5 días después para reparaciones mayores las cuales fueron suspendidas en abril de 1945.El Junyō a pesar de su inexistente protección antitorpedos y exiguo blindaje sobrevivió al ataque de al menos 4 torpedos y dos bombas.
El Jun'yō en Sasebo junto a dos submarinos tipo HA-201.
El USS
Enterprise
siendo bombardeado en la Batalla de Santa Cruz por bombarderos del
Junyō
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