Juana fue originalmente prometida en 1401 a Martín I de Sicilia, que era viudo de María de Sicilia, quien no le había dado hijos sobrevivientes.

Sin embargo, los planes cambiaron y Martín se casó con Blanca,[1]​ la hermana de Juana.

La pareja estuvo casada durante once años pero no tuvo hijos.

Gobernó Navarra en nombre de sus padres durante sus ausencias en el extranjero.

Juana murió en Bearne en julio de 1413, sin hijos.