Más tarde, en 1478, el mismo rey le concedió el título de marqués de Montemor-o-Novo - fue el primer y único marqués de este título.

Antes del 25 de julio de 1460, se casó con su prima en 5° grado, D. Isabel de Noroña (sobrina de Cristóbal Colón), una hija natural del arzobispo de Évora, Pedro de Noroña (quién era él mismo, un nieto del rey Fernando I de Portugal y nieto del rey Enrique II de Castilla a través de una línea ilegítima)y de Blanca Días Perestrelo (c. 1390 -?

Debido a las contradicciones con la Corona sin embargo fue expulsado de Montemor-o-Novo por el rey Juan II de Portugal quién sucedió en el trono portugués y comenzó activamente su política contra el poder de la alta nobleza (a saber, las familias Braganza y Viseu) Juan no tardó en ser uno los objetivos del rey.

Escapó a Castilla, pero en Portugal fue condenado por traición y condenado a muerte, siendo su estatua simbólicamente ejecutada en Abrantes, el 12 de septiembre de 1483, debido a que Juan se negó a regresar a Portugal para ser juzgado.

Murió en Sevilla, el 30 de abril de 1484, donde fue enterrado junto a su esposa, en el Monasterio de Santa Paula.