Fue hijo del doctor Germán Somolinos D’Ardois, quien fue un exiliado español que salió de su país durante la Guerra Civil Española.
Juan Somolinos llegó a México siendo un bebé casi recién nacido, realizó sus estudios en la Academia Hispano Mexicana.
Obtuvo su licenciatura con la tesis Francisco Flores, primer historiador de la medicina mexicana en 1963.
Realizó estudios especializados en anatomía patológica en el Instituto Pasteur en Francia.
De 1963 a 1977 trabajó en el laboratorio de la clínica 61 del Instituto Mexicano del Seguro Social.