Por su segundo matrimonio tuvo dos hijas: A la muerte de Juan II, su única hija sobreviviente legítima Carlota lo sucedió en el trono.
Durante su gobierno, Corycus, único reducto chipriota en Anatolia se perdió con Karamanli en 1448.
Su padre finalmente lo perdonó y restauró en el arzobispado.
Jacobo y Helena eran enemigos, que competían por la influencia sobre Juan.
Después que Helena murió en 1458, parecía que Juan designaría como su sucesor a Jacobo, pero Juan murió antes de poder hacerlo.