En Valencia aprendió francés y entró en contacto con las filosofías materialistas de la Ilustración, con lo que empezó a volverse deísta.
Trasladado a Burdeos, publicó allí una Revue grammaticale de la langue espagnole y un Examen raisonné de l'emploi des verbes ser et estar.
Casado con una francesa, nació en 1833 en Poitiers su único hijo, Philip Hermógenes Calderón, que llegaría a ser un famoso pintor inglés.
Asimismo escribió varios ensayos, algunos sobre el ateísmo de Spinoza, en dos revistas protestantes que editó en castellano, El Catolicismo Neto y El Examen Libre, cuyo cometido era divulgar la fe protestante y que fueron repartidas de forma clandestina en España.
Marcelino Menéndez Pelayo le sitúa entre los tres heterodoxos españoles más importantes del siglo XIX: Fue, además, un competente cervantista.