Su hermano, Manuel Carvajal Cavero, fue también gobernador de Yucatán, este interino, cuando José Segundo dejó el poder en 1832.

En 1828 regresó a Campeche para poco después participar en la asonada en contra del federalismo que se estaba instaurando en todo México.

Al llegar este al puerto de Sisal, no le dejaron desembarcar pidiéndosele que regresara a México, so pena de muerte.

En ese punto rompió las relaciones con México hasta que la nación no adoptase un régimen centralista.

[2]​ En noviembre de 1832 fue derrocado y en 1833 Antonio López de Santa Anna, que más tarde buscaría establecer el centralismo en México, lo intentó expulsar del país al expedirse la Ley del Caso.