Durante el gobierno constitucional de Nicolás de Piérola (1895-1899), figuró entre los principales colaboradores del régimen, como miembro del Partido Demócrata.

Pero al no hallarse entonces en Lima, no llegó a asumir sus funciones; finalmente, el 19 de agosto renunció por motivos de salud.

Sin embargo, al reestructurarse el gabinete (cuya presidencia se confió a José Jorge Loayza), De la Puente se mantuvo al frente del portafolio de Gobierno, hasta el fin de la administración Piérola.

Le tocó enfrentar la agitación subversiva desatada en 1899, con focos de rebelión aislados en el norte, centro y oriente del país.

[1]​[2]​[3]​[4]​[5]​[6]​[7]​[8]​ En 1907, al reorganizarse el Partido Demócrata, integró su comité directivo.