En la campaña que siguió, Morales combatió en las batallas de Yeruá, Don Cristóbal y Sauce Grande.

Tomó parte en el posterior avance sobre Buenos Aires y en el repliegue al norte.

Combatió en la batalla de Quebracho Herrado, en San Cala y Famaillá.

Se batió en la salida general hasta Las Tres Cruces en el Buceo, en el Cerro y en otras acciones.

Héroe en Tuyutí, luchó en Boquerón, Curupaytí, Humaitá, Lomas Valentinas y Angostura.

En una impresionante ceremonia, escoltada en formación por el Batallón N° 10 de línea al mando del teniente coronel Toscano, estuvieron presentes entre otros los ministros Manuel Quintana, Eduardo Costa, José A. Terry y el general Luis María Campos, los tenientes generales Bartolomé Mitre y Nicolás Levalle, los generales José Miguel Arredondo, Viedma, José Inocencio Arias, Antonio Dónovan, los coroneles José María Fernández, Pérez, Francisco Riveiro, Rodríguez, Martín Guerrico, comandantes Joaquín Montaña, Guillermo Rawson, Ricardo Kleine, Tolosa, Saraví, Nadal, Sáenz, Masson, los doctores José María Gutiérrez, Mariano Varela, Luis Varela, Juan Torrent, Aristóbulo del Valle, Dardo Rocha, Carlos Urien, Orma, José María Niño, Bonifacio Lastra, etc.

Mitre lo llamó "uno de los jefes más beneméritos que ha servido a la patria".