Ogdon nació en Mansfield Woodhouse (Nottinghamshire) y asistió a la Manchester Grammar School, antes de estudiar en el «Royal Manchester College of Music» (el predecesor de la «Royal Northern College of Music»), entre 1953 y 1957, donde tuvo como compañeros a Harrison Birtwistle, Alexander Goehr, Elgar Howarth y Peter Maxwell Davies.
En su repertorio más familiar, puso de manifiesto su profunda sensibilidad musical, siempre apoyada por una colosal técnica.
Una prevista sinfonía basada en la obra de Herman Melville y una ópera cómica quedaron inconclusas.
La BBC hizo una película sobre su vida titulada Virtuoso, basada en la biografía escrita por su esposa y colega, la pianista, Brenda Lucas Ogdon.
Su discografía puede encontrarse en la página de la John Ogdon Foundation compilada por Michael Glover.