Fue ordenado como sacerdote en 1962, y comenzó a ejercer su labor pastoral en Alemania.

[5]​ Del papa Benedicto XVI ha dicho: Él [Benedicto XVI] tiene la inteligencia de 12 profesores y es tan piadoso como un niño en el día de su primera comunión.

[9]​ En abril de 2016, el papa Francisco emitió la exhortación apostólica Amoris laetitia.

Meisner y otros tres cardenales: Carlo Caffarra, Walter Brandmüller y Raymond Leo Burke) enviaron dubia (dudas) en privado, seguidas de una carta pública ("Buscando la claridad: una petición para desatar los nudos en Amoris Laetitia") en noviembre de 2016, preguntando a Francisco para aclarar varios puntos de la doctrina.

La primera dubia preguntó sobre la recepción de los sacramentos por los divorciados y vueltos a casarse.

La carta pública preguntaba sobre cuestiones fundamentales de la vida cristiana y hacía referencia a la encíclica Veritatis splendor del Papa Juan Pablo II.