Debutó con Brondby IF, jugó la Liga Europa de la UEFA 2010-11, perdiendo en la ronda de play-off contra Sporting Lisboa.
Para la temporada 2013-14 se marchó como libre al FC Nordsjælland para jugar la Liga de Campeones de la UEFA 2013-14.
A mediados de 2014 fue transferido al FK Austria Viena.
A mediados de 2017 fue transferido al Udinese Calcio por 1,50 mill.
Tras jugar con la selección de fútbol sub-16 de Dinamarca, la sub-17, la sub-18, la sub-19, y la sub-21, Jens Stryger Larsen fue convocado por el seleccionador Åge Hareide para los partidos amistosos contra Armenia y Liechtenstein.