[1] Los nuevos participantes fueron los equipos ascendidos de la Japan Football League: el campeón Otsuka Pharmaceutical, quien pasó a competir bajo la denominación de Tokushima Vortis, y el tercero, Thespa Kusatsu; ambos cuadros tuvieron sus respectivos debuts en el torneo.
Por otra parte, salió subcampeón Avispa Fukuoka, quien también ganó su derecho a disputar la J. League Division 1.
Además, Ventforet Kofu venció en la promoción entre J1 y J2 a Kashiwa Reysol, de manera tal que se transformó en el tercer ascendido a la máxima categoría y el primer equipo en lograrlo mediante este método.
Una victoria se puntuaba con tres unidades, mientras que el empate valía un punto y la derrota, ninguno.
Para desempatar se utilizaron los siguientes criterios: Los dos equipos con más puntos al final del campeonato ascenderían a la J. League Division 1 2006.