La InterLiga 2004 es la primera edición del torneo el cual reparte los dos boletos a los equipos mexicanos para la Copa Libertadores 2004.
El torneo fue ganado por el Santos que luego de empatar a 2 goles con el Atlas logró derrotar en tanda de penales (4:3) y así obtuvo el lugar de México 1, mientras que el América que derrotó en la Final 2 al Morelia (3:1) disputó el partido de recalificación ante el Atlas a partidos de ida y vuelta, y en ambos ganó por mismo marcador (2:1) con lo que logró calificar como México 2 a la Copa Libertadores 2004.
Monterrey ocupó la posición número 8, por lo que tenía derecho a jugar en la InterLiga 2004, pero tuvo que asistir a la Copa de Campeones CONCACAF 2004 por lo que su lugar fue tomado por el Atlas.
Fuente: [cita requerida]Criterios de clasificación: Puntos · Diferencia de goles · Goles a favor · Play-offSantos Campeón
6 goles Reinaldo Navia - América 4 goles Jared Borgetti - Santos Manuel Pérez -Atlas Carlos María Morales - Atlas 3 goles Sebastián González - Atlante Cuauhtémoc Blanco - América 2 goles Ariel González - América Carlos Pavón - Morelia Miguel Ángel Zepeda - Toluca Omar Bravo - Guadalajara Damián Álvarez - Santos 1 gol Rodrigo Ruiz - Santos Johan Rodríguez - Santos Uzziel Lozano - Toluca Jaime Durán - Atlas Aarón Padilla - Atlante José Mendoza - Tigres Daniel Herrera - Atlas Juan Pablo García - Atlas Jesús Palacios - Tigres Fernando Martel - Atlante José Manuel Abundis - Toluca Javier Saavedra - Tigres Adolfo Bautista - Guadalajara Eduardo Rergis - Tigres Vicente Matías Vuoso - Santos Roberto Palacios - Morelia Omar Trujillo - Morelia Héctor López - Santos Franky Oviedo - América Jesús Mendoza - América En el desarrollo del torneo se mostraron 83 tarjetas amarillas (5 por partido), así como 8 tarjetas rojas (1 cada 2 juegos).