[4] La Revolución de 1868 interrumpió el curso normal de las clases y si bien, según dijo el en aquel momento director del centro, "derrumbó instituciones seculares y conmovió los más hondos cimientos del edificio social en España",[4] lo cierto es que antes de dos meses la actividad se había reanudado, con importantes cambios pedagógicos y académicos.
Entre los que en aquel momento se ofrecieron a dar clases gratuitamente estaban Nicolás Salmerón y Francisco Giner de los Ríos.
También es notable en el proyecto original la disposición escalonada de bancos corridos en las aulas para los alumnos, frente a la tarima reservada al profesorado, aunque solo se ha conservado en el aula magna.
[2] Entre 1936-39, la actividad académica del Cisneros quedó interrumpida por la Guerra Civil, dada su proximidad al frente de la Ciudad Universitaria y la caída de obuses en el edificio, que llegaría a sufrir algunos desperfectos.
La primera mujer que ocupó el cargo de directora fue Caridad Robles Mendo, en 1972.
En una breve lista de alumnos ilustres –claramente determinada por esta última circunstancia – podrían anotarse los nombres de profesores como Ramón Menéndez Pidal, María Goyri, José Deleito, Juan Dantín Cereceda, Francisco Rodríguez Adrados, María Elena Gómez Moreno o Antonio Colino; pensadores como José Luis López Aranguren o Julián Marías; actores como Fernando Fernán Gómez, Andrés Pajares o Fernando Guillén; políticos como Manuel Azaña, José Antonio Primo de Rivera, Eduardo Dato, Clara Campoamor y Victoria Kent; escritores como los hermanos Manuel y Antonio Machado, Manuel de Sandoval y Cútoli, Jorge Semprún, Jesús López Pacheco; cineastas como José Luis Garci y Gerardo Vera; aristócratas como el conde de Romanones o el conde de Toreno; militares como Manuel Gutiérrez Mellado; o empresarios como Santiago Bernabéu o pretendidas niñas prodigio como Hildegart Rodríguez Carballeira.