Debido a que Hot Rats consiste principalmente en composiciones instrumentales influenciadas por el jazz con amplios solos, la música suena muy diferente a los álbumes anteriores de Zappa, especialmente con The Mothers of Invention, que presentaban interpretaciones vocales satíricas con un amplio uso de música concreta y edición.
El multiinstrumentista Ian Underwood es el único miembro de the Mothers que aparece en el álbum y fue el principal colaborador musical.
Durante las sesiones, se grabaron más de 13 canciones, incluyendo las que terminaron en el LP.
"Dame Margret's Son To Be a Bride" es otro descarte, que pasó por dos versiones, la primera, contando con un órgano, tiene un ritmo lento; en la segunda se sustituye el órgano por un piano y es mucho más rápida, esta última versión luego fue editada, agregando varios instrumentos y voz de Davey Moire, para que en el álbum de 1978, Studio Tan, apareciera como "Let Me Take You to the Beach".
Otro tema grabado durante estas sesiones, titulado "Transition", luego renombrada como "Twenty Small Cigars", fue lanzada más tarde en Chunga's Revenge.
Todas las canciones y composiciones fueron compuestas por Frank Zappa durante la realización del álbum, pero contando con músicos de sesión adicionales.