Con sede en Tampa, Florida, los hospitales son propiedad y están operados por la organización Shriners International, anteriormente conocida como la Antigua Orden Árabe de los Nobles del Santuario Místico, una organización relacionada con la francmasonería cuyos miembros son conocidos como Shriners.No se requiere que los pacientes tengan ninguna afiliación familiar con la orden de los Shriners ni con la francmasonería.Los Shriners habían considerado cerrar las instalaciones en Shreveport, Luisiana; Greenville, Carolina del Sur; Erie, Pensilvania; Spokane, Washington; Springfield, Massachusetts y Galveston, Texas, eliminando un total de 225 camas.Los hospitales de Boston, Chicago, Shreveport y Portland también brindan tratamiento para niños con afecciones craneofaciales, especialmente hendiduras faciales.Con frecuencia, los conductores Shriners, ofrecen transporte gratuito a los pacientes y sus familias en todo el país, en furgoneta o en avión.Los niños aceptados para recibir tratamiento pasan a formar parte del sistema del Hospital Shriners hasta que cumplen 18 años o, a veces, 21 años, y cumplen los requisitos para recibir tratamiento hospitalario y ambulatorio para todas las facetas de su discapacidad.