El paso previo a esas cuatro reacciones es la activación de los ácidos grasos con CoA formando Acil coenzima A (acil CoA, R–CO–SCoA), la cual tiene lugar en el retículo endoplasmático (RE) o en la membrana mitocondrial externa, donde se halla la acil-CoA sintetasa (o ácido graso tioquinasa), la enzima que cataliza esta reacción:[1] El ácido graso se une al coenzima A (CoA-SH), reacción que consume dos enlaces de alta energía del ATP, generando Adenosina Monofosfato, Difosfato inorgánico y agua.
La carnitina es un derivado aminoacídico que participa en el circuito vascular reduciendo niveles de triglicéridos y colesterol en sangre.
Se produce naturalmente en el hígado a partir de los aminoácidos L-metionina y L-lisina.
La enzima acil-CoA-deshidrogenasa, una flavoproteína que tiene a la coenzima Flavina-Adenosina(FAD) unida covalentemente, cataliza la formación de un doble enlace entre C-2 y C-3.
El producto final es 3-cetoacil-CoA con lo que el carbono beta ya ha sido oxidado y está preparado para la escisión.