Estuvo fuertemente implicado en la segunda guerra de los Barones, apoyando al Rey y al Príncipe Eduardo contra los rebeldes dirigidos por Simon de Montfort.

Desde sus nuevas tierras en Gales del sur, intentó recuperar los derechos palatinos vinculados al Condado de Pembroke, pero sus energías no se limitaron a esto.

Además, algún problema en Gales provocó un enfrentamiento entre él y Simon de Montfort, que se convertiría en el líder de los rebeldes.

Aun así, por 1265 estaba de vuelta, desembarcando en Pembrokeshire, y participando en el Asedio de Gloucester y la victoria final realista en Evesham.

William y Joan de Munchensi tuvieron los siguientes hijos: