Allí estudió desde muy joven a los poetas griegos y luego teología en el Collegium Carolinum de Zúrich.

En 1782 escribió el ensayo Naturaleza, cuya autoría se solía adjudicar a Goethe, pero luego el propio Goethe rectificó, atribuyendo correctamente el texto a Tobler.

[2]​ Este texto sobre la naturaleza, publicado inicialmente de manera anónima y erróneamente atribuido, tuvo (y continúa teniendo) amplia difusión y gran recepción: noventa años después de su publicación, impactaría profundamente a Sigmund Freud, constituyendo la motivación para que iniciara sus estudios de medicina.

En 1800 fue elegido, por un breve periodo, miembro del Senado de la República Helvética en Berna y para asumir esta función tuvo que renunciar a su puesto parroquial en Veltheim.

En 1801 escribió el discurso: Johann Caspar Lavater, el maestro de la verdad y filántropo.