Es conocido por sus papeles secundarios en grandes filmes como Nacido el 4 de Julio, The Doors, Pulp Fiction y por su participación en películas independientes y series de televisión.
Su hermano mayor, Robert Whaley, inicialmente quería ser actor y Frank empezó a interesarse en la profesión siguiendo los pasos de su hermano.
Su hermano es el cantante del grupo The Niagaras, y también ha compuesto la música para el debut cinematográfico de Frank, Joe el rey.
Frank fundó una compañía teatral llamada Malaparte, junto con Ethan Hawke, Robert Sean Leonard y Steve Zahn.
Su más reciente colaboración es en Estafadoras de Wall Street (2019), protagonizada y producida por Jennifer Lopez.