Se conecta indirectamente a la costa abierta del océano Pacífico, a través del canal Darwin.
El río Aysén desemboca en la cabecera del fiordo.
en 2002) se ubica en la orilla del fiordo.
La zona del fiordo está fuertemente influenciada por una amplia extensión de marea (de sobre 8 metros).
A su vez, esta proviene de la corriente circumpolar antártica, una corriente marina superficial mayor que fluye por la costa occidental de Chile hacia la latitud 41° S. Esta corriente se dispersa en la corriente de Humboldt por el norte, y en la corriente del Cabo de Hornos por el sur, lo que hace aumentar la temperatura marina y posibilitando la evaporación del agua de mar, lo que desemboca en precipitaciones de entre 4.000 a 7.000 mm anuales en los Andes del Sur de Chile.