Cuando subió al trono se enfrentó a la rebelión del cantón de Appenzell.

Federico reclutó a un gran contingente, compuesto principalmente por nobles de Suabia y las cuotas establecidas para la ciudad gobernada por los Habsburgo (incluyendo la principal que era Constanza, así como las ciudades imperiales aliadas.

En 1407 estallaron en varias áreas del Trentino y, en particular, en Nonsberg (o Val di Non en italiano) varias revueltas campesinas, mientras que la ciudad y los nobles de Trento se rebelaban contra el obispo.

En 1410 el duque Federico tuvo duros enfrentamientos con Enrique VI de Rottenburg, que había aceptado en sus territorios a los bávaros.

En una serie de operaciones militares contra Venecia en 1413 logró conquistar Valsugana, aunque luego tuvo que ceder Rovereto y varios castillos de la Vallagarina a Venecia.

Tuvieron una hija: En 1410, Federico se casó en segundas nupcias con la princesa Ana de Brunswick - Göttingen.