La estación, de vía doble, cuenta con un único acceso por rampa en cada andén.Como única excepción, los servicios directos del trayecto 1D de dicha línea entre Bilbao y el Duranguesado, y los directos con Guernica dentro de la E4, por la mañana y el mediodía, no realizan parada en Basauri en ambos sentidos.Adyacente a los andenes de cercanías, Ariz-Basauri cuenta con una playa con numerosas vías y una grúa, empleadas para clasificar e intercambiar cargas entre convoyes de mercancías de vía estrecha, operados, a día de hoy, por Renfe Mercancías (antes FEVE) y Euskotren Kargo.Durante décadas, tras la transferencia de las infraestructuras operadas por y propiedad de Ferrocarriles Vascongados a la compañía pública FEVE, la titularidad de las instalaciones destinadas al tráfico de mercancías correspondió a dicho ente estatal, hasta que fueron heredadas por Adif al extinguirse la empresa, ya en 2013.No se ha aclarado hasta la fecha qué solución se encontrará para el tráfico de mercancías, que podría mantenerse, con ciertos cambios.
Entrada oeste a Ariz-Basauri. Se aprecia la conexión con el ramal a la extinta estación de Azbarren (agujas de desvío hacia la izquierda), a través del cual se transfieren convoyes del o al
Ferrocarril de Santander a Bilbao
